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| Rank | Matches | Goals | Points | ||||||||||||||||||||
| P | W | D | L | F | A | Diff. | |||||||||||||||||
| 1 | FC Rubin Kazan | Russia | 30 | 18 | 6 | 6 | 44 | 26 | 18 | 60 | |||||||||||||
| 2 | PFC CSKA Moskva | Russia | 30 | 16 | 8 | 6 | 53 | 24 | 29 | 56 | |||||||||||||
| 3 | Dinamo Moscow | Russia | 30 | 15 | 9 | 6 | 41 | 29 | 12 | 54 | |||||||||||||
| 4 | Amkar | Russia | 30 | 14 | 9 | 7 | 31 | 22 | 9 | 51 | |||||||||||||
| 5 | Zenit St. Petersburg | Russia | 30 | 12 | 12 | 6 | 59 | 37 | 22 | 48 | |||||||||||||
| 6 | Krylya Sovetov | Russia | 30 | 12 | 12 | 6 | 46 | 28 | 18 | 48 | |||||||||||||
| 7 | Lokomotiv Moscow | Russia | 30 | 13 | 8 | 9 | 37 | 32 | 5 | 47 | |||||||||||||
| 8 | FC Spartak Moskva | Russia | 30 | 11 | 11 | 8 | 43 | 39 | 4 | 44 | |||||||||||||
| 9 | FC Moscow | Russia | 30 | 9 | 11 | 10 | 34 | 36 | -2 | 38 | |||||||||||||
| 10 | Terek Grozni | Russia | 30 | 9 | 8 | 13 | 28 | 42 | -14 | 35 | |||||||||||||
| 11 | Saturn | Russia | 30 | 7 | 12 | 11 | 26 | 30 | -4 | 33 | |||||||||||||
| 12 | Spartak Nalchik | Russia | 30 | 8 | 8 | 14 | 30 | 39 | -9 | 32 | |||||||||||||
| 13 | Tomsk | Russia | 30 | 7 | 8 | 15 | 23 | 39 | -16 | 29 | |||||||||||||
| 14 | Khimki | Russia | 30 | 6 | 9 | 15 | 34 | 54 | -20 | 27 | |||||||||||||
| 15 | FC Shinnik Yaroslavl | Russia | 30 | 5 | 7 | 18 | 25 | 48 | -23 | 22 | |||||||||||||
| 16 | Energiya V | Russia | 30 | 3 | 12 | 15 | 24 | 53 | -29 | 21 | |||||||||||||
